Los quirópteros (murciélagos) y las aves son los grupos de vertebrados que con mayor probabilidad interactúan con los árboles de estudio del programa Life On Trees. Directamente, ya que los frutos producidos son sin duda consumidos por frugívoros, o indirectamente, ya que el árbol y sus plantas epífitas albergan una fauna de insectos que atraen a aquellos que son insectívoros.
De las especies de mamíferos susceptibles de interactuar con el árbol de estudio o con alguna de las plantas vasculares que sustenta, los quirópteros son sin duda el grupo más numeroso. Evidentemente, es difícil demostrar una asociación sin observación directa (poco probable con animales nocturnos), no obstante pensamos que sería interesante caracterizar la presencia de estos animales cerca de los árboles del programa, así como en sus copas, para obtener una imagen de la fauna en las inmediaciones.
Los quirópteros se estudiaron colocando redes japonesas (redes de niebla) durante varias noches al pie de los árboles del estudio y en sus copas. Las aves se observaron y fotografiaron desde la plataforma suspendida en las copas de los árboles estudiados.